#paper doi:10.1177/0141076816688346 Prevention and treatment of diabetic foot ulcers 糖尿病足是糖尿病最常见且危害很大的并发症之一，表现为足底溃疡坏死，严重者需要截肢。本文综述了糖尿病足的预防和治疗。病因方面，大致可理解为异常的糖代谢产物诱发神经细胞氧化应激，这些受损的神经元引起了异常的足底压力分配、负重、步态、痛觉敏感性、汗腺功能、脚型等。干预的主要措施是预防，包括医护人员对足部护理的投入程度，以及患者自身被教育的程度。治疗方面，控制血糖是根本，以及及时有效的清创术（清除浅表及深部的坏死及过度角化组织）、药物治疗、各种各样促进伤口愈合的敷料、负压抽吸伤口组织液以改善灌注和促进肉芽形成、用蛆去除坏死组织、使用生长因子促进组织愈合等。

#paper doi: 10.1111/j.1467-8624.2008.01164.x Social and Cognitive Correlates of Children’s Lying Behavior 命令孩子在独处时不要触碰玩具，他能否做到？又是否会承认？这是研究儿童说谎的常用办法。约四成的3岁儿童会说谎，这一比例在5-7岁儿童中更高。相应的，3岁儿童的圆谎能力（语义泄漏控制）很弱，但一半的六七岁的儿童已经发展了这个能力。此外，儿童圆谎能力越弱，表明其抑制控制盒工作记忆越差，而儿童对说谎的道德概念比较弱，但是道德认识越强的儿童说谎的概率越低。

#paper doi:10.1177/0706743718773728 An Overview of Animal Models Related to Schizophrenia 精神分裂是一种复杂的精神类疾病，疾病模型的不成熟也限制了对该疾病的病因及治疗的进一步的深入理解。在本综述中，作者回顾了多种精神分裂动物模型的造模方式，按照原理可分为发育模型、药物诱导模型、遗传模型、性别模型等几大类。作者细说了各类模型的总体方法和数据细节，但是可以看出，这些造模方法都有遗传因素有很大关联。

#paper doi:10.1177/0146167218783195 The Cynical Genius Illusion: Exploring and Debunking Lay Beliefs About Cynicism and Competence 本文讨论的话题是“犬儒主义/愤世嫉俗/玩世不恭”，即那些精致利己、精明世俗、常持怀疑论且做预防性推理的人，与之对立的是非犬儒主义者/理想主义者，他们对陌生人的无私行为报以更少的动机揣度。通常，在艺术作品中愤世嫉俗者如福尔摩斯总被刻画成有能力、洞察力强、对环境的适应能力更强的人。为了确认“犬儒主义者是否拥有更强的能力（本文中泛指认知能力、学历、技能等具体技能）”，作者做了6个调查。前3个调查发现，世人的观念中，普遍认为犬儒主义者比非犬儒主义者能力更高，然而在后三个调查中，通过大规模的调查，作者发现真实情况与世人认识相反：非犬儒主义者的能力更强一些，绝大多数参与者预计愤世嫉俗的人在一系列认知任务和认知能力测试中比不愤世嫉俗的人表现得更好。作者分析认为，这可能是因为更高水平的教育和能力可能有助于个人首先发现并避免潜在的欺骗，从而减少负面社会经历的可能性，这反过来可能有助于对人性产生更积极的看法，此外，高水平的能力可能使个人能够正确识别其环境的“腐败”，并调整自己的愤世嫉俗程度以与之相匹配。最后，艺术作品中过于强调“愤世嫉俗的天才”也会强化公众的认知偏见。

#paper doi:10.1002/cyto.a.23690 , Best Practices for Preparing a Single Cell Suspension from Solid Tissues for Flow Cytometry 本文是一篇综述，描述了从组织制备单细胞悬液的一般性经验和原则。制备单细胞悬液的本质是消化和降解掉细胞间的连接物，即胶原蛋白、蛋白聚糖和糖蛋白,同时也要注意试剂不能破坏细胞膜的完整性，以保护细胞表面分子的完整性，避免造成表位丢失。 分散酶、胶原酶、透明质酸酶用作将组织解离成小细胞团块，其中分散酶可能会破坏细胞表位。细胞-细胞间存在3种链接：1)闭塞连接、2)通信连接和3)锚定连接，使用胰蛋白酶或木瓜蛋白酶破坏他们。胰蛋白酶会对细胞膜蛋白有非常严重的影响，且会导致游离DNA诱导的细胞聚集，因此要避免使用。一种替代方案是木瓜蛋白酶，但其同样会导致游离 DNA 诱导的细胞聚集。还需要引入DNA酶来降解游离的DNA，通常使用DNase-I而非DNase-II，因为前者不启动细胞凋亡途径。钙离子在这一步是必要的，因其能充当DNA酶的激活剂。 关于酶的使用，确定酶解中所用酶的最佳强度和浓度是经验性的，对于正确分离细胞和成功消化组织至关重要。根据酶的不同，酶解也可以在 4°C或冰上进行，这些较低的温度可能会减慢酶的反应速率并延长潜伏期，但有助于最大限度地减少细胞死亡。 酶解结束后推荐使用流式计数，添加核染色剂可以区分完整细胞和细胞碎片，添加活性染料可以定量死细胞的百分比。如果下游是流式分析且需要保存一段时间，最好使用多聚甲醛固定，特别是对于脆弱/异质群体（例如肺单细胞）。 文章最后还提供了其他有益建议。

#paper doi: 10.1002/ctm2.1354 IMPACT: A web server for exploring immunotherapeutic predictive and cancer prognostic biomarkers 这是一篇临床转化医学的数据库的文章，作者来自燃石、中国国家肿瘤中心等单位。数据库纳入了23000+样品、覆盖37种肿瘤，数据来源包括公共数据库、文献来源的数据集以及作者自己收集的一系列数据。数据库的主旨是挖掘和分析影响肿瘤预后的生物标志物。数据库功能还是比较多的，与既有的数据库相比更加灵活和细化，操作比较简便和直观，界面简洁一目了然，使用者可快速执行感兴趣的操作，提高分析效率。

#paper doi: 10.1128/jb.00165-23 Three genes controlling streptomycin susceptibility in Agrobacterium fabrum 链霉素是一种氨基糖苷类抗生素，通过干扰16S rRNA的正常工作阻碍细菌复制，实现抗菌效果。农杆菌的链霉素抗性通常由rpsL、rsmG（也称为gidB）和rrs突变引起。本课题中，作者使用链霉菌做连续培养筛选和分析，获取了在低浓度和高浓度抗生素下筛选到的耐药菌准，由于传代筛选过程中未引入外源基因，表明内源性基因的突变调控了耐药性。由于低浓度下的突变体的耐药性高于高浓度下的突变体，因此作者分别对这两批突变体进行了测序。作者首先发现高浓度突变株的rpsL发生了突变而低浓度的没有，对突变的rpsL等位基因进行转移实现，验证了该等位基因能赋予野生型耐药性。对6株低浓度突变体的测序发现，都发生了导致rsmG功能丧失的突变，随后的敲除和回补实证实了该基因突变对链霉素抗性的影响。

#paper doi：10.1128/iai.00252-23 Protection against lethal sepsis following immunization with Candida species varies by isolate and inversely correlates with bone marrow tissue damage 文章通过攻毒保护实验探讨了不同念珠菌接种小鼠后引发的免疫保护能力。结果认为，不同毒力表型的分离株提供的保护作用各不相同，不提供交叉保护。第二，股骨组织的铁死亡和结构完整性可作为定量指标衡量分离株的毒力强弱。此外还有一个意料之外的现象：毒力最强的分离株提供的免疫保护作用却最弱。

#paper doi: 10.1128/iai.00154-23 The choline-binding proteins PspA, PspC, and LytA of Streptococcus pneumoniae and their interaction with human endothelial and red blood cells 这是关于肺炎链球菌毒力因子研究的最新文章，研究路线也比较基础，通过同源重组获得靶蛋白的突变体，紧接着测毒力形状，包括生物膜形成能力、细胞染毒后的代谢活性、对细胞的粘附性、溶血活性、对细胞中特定蛋白表达的影响等，最后使用string预测了蛋白互作网络。

#paper doi：10.1128/iai.00037-23 Identification of Virulence Factors Involved in a Murine Model of Severe Achromobacter xylosoxidans Infection 本文使用正常鼠、免疫低下鼠、正常毒株、弱毒株进行攻毒实验，以此研究木糖氧化无色杆菌(Ax)的毒力影响因素。核心结论是，插入突变研究结果表明， III 型分泌系统、Vi 胶囊、antisigma-E 因子，以及ArtA 粘附素是影响毒力强弱的主要因素。

#paper doi：10.1093/molbev/msad102 Caecilian Genomes Reveal the Molecular Basis of Adaptation and Convergent Evolution of Limblessness in Snakes and Caecilians 这是一篇比较基因组阐释进化问题的论文，比较的是蚓螈与蛇的基因组的共同特征，因为二者趋同进化至无足。作者分析了4个内容：重复区域分析、基因家族分析、正选择基因分析、ZRS增强子损失分析。分析结果集中于2点，第一点是这两个物种的基因组的 69% 以上都是由重复区域组成，其中逆转录转座子最为丰富。第二个发现是蚓螈的ZRS基因的增强子区域发生了缺失，这个基因在蛇中发生了突变，且该突变基因导入小鼠后会产生蛇样突变。这组证据强烈暗示该基因与无足表型的关联。

#paper doi：10.2147/CCID.S247390 Asian Hair: A Review of Structures, Properties, and Distinctive Disorders 这是一篇讲头发（发质）的综述，重点是亚洲人的发质。作者首先对比了亚欧非人种头发的各项指标特性，包括生长速度、头发密度、硬度刚性韧性等。随后简单介绍了头发的物理结构，为后文的介绍做了铺垫。后文中大致介绍了亚洲人发质特性的成因，主要归结于正选择下的基因变异，即EDAR基因。最后作者还介绍了在亚洲人中更高发的毛发疾病，包括困扰当下年轻人的脱发和毛囊炎等疾病。

#paper doi：10.3390/ph16030328 Chemical Composition and Antimicrobial Potential of a Plant-Based Substance for the Treatment of Seborrheic Dermatitis 脂溢性皮炎 (SD) 是最常见的头皮皮肤病，全世界高达 50% 的成年人都会发生。SD的发生与多种因素有关，但确切的发病机制仍未阐明。目前对SD的治疗以抗真菌和抗炎为主，但长期使用这类药物不仅有引起副作用的风险，真菌耐药性的诱导也是不可忽视的风险之一，为此作者将目光投向了植物源药物，即本文中的互叶白千层叶油（TTO）。作者首先使用GS/MS分析了成分，确定了 TTO 特有的 10 种抗菌单萜和倍半萜以及以前未在 TTO 中检测到的 7 种新萜。随后的抑菌试验和抗真菌实验表明这种物质的抗菌活性与苯扎氯铵、酮康唑和氯咪唑相当；因此，该物质有望用于进一步研究和评估可能用于治疗 SD 的药物开发。

#paper doi：10.1128/iai.00529-22 Hyperglycemia Increases Severity of Staphylococcus aureus Osteomyelitis and Influences Bacterial Genes Required for Survival in Bone 过去的研究中发现高血糖患者更容易发生严重的金黄色葡萄球菌感染，这是一种广泛存在于环境中且具有重要公共卫生意义的细菌。为了这种现象的原因，研究者使用小鼠作为实验动物，构建了高血糖模型，同时使用转座子测序技术对金黄色葡萄球菌随机插入突变，随后攻毒检验毒力。实验结果是得到一个基因，sodA ，编码超氧化物歧化酶 A，与该菌在高糖环境下的毒力增加有关。从技术和研究方案来说很成熟很简单，但是得到的结论很有价值且深远。但该基因如何影响金黄色葡萄球菌在特定环境下的表型，以及这种调控是否具有种属特异性、该基因是否具有未探明的功能，仍然未知。当然还需要更多的实验从不同角度验证本文的结论。

#paper doi：10.3389/fvets.2020.00388 Assisting Decision-Making on Age of Neutering for 35 Breeds of Dogs: Associated Joint Disorders, Cancers, and Urinary Incontinence 这是一篇有关犬的最佳绝育年龄的循证研究。此前已经发现，绝育会增加犬罹患关节疾病和癌症的风险，无论性别是雌性或雄性。绝育时的年龄也同样会影响到这些疾病的发生，但由于不同品种间犬的体格和遗传背景相差很大，因此作者团队对包括柯基、贵宾、比格、金毛、德牧在内的共35个品种的犬的绝育年龄与健康状况做了调查，样本主要来源于作者所在的动物医院。作者详细报告了每个品种犬的关节疾病与肿瘤疾病患病风险增加与绝育年龄或性别的相关性，总的来说不同品种有相应的最佳绝育年龄，甚至同一品种的不同性别个体也有不同的最佳绝育年龄。但这篇研究中没有涉及到不同品种杂交犬的最佳绝育年龄。

#paper Sex Matters: Male Hamsters Are More Susceptible to Lethal Infection with Lower Doses of Pathogenic Leptospira than Female Hamsters https://doi.org/10.1128/IAI.00369-18 过去的研究中发现女性比男性更容易感染钩端螺旋体，但现实生活中男性感染钩端螺旋体的发病率和重症率却高于女性，为解释这个矛盾的现象，作者使用仓鼠做了动物实验。使用人工攻毒的方式建立动物模型，他们发现不同性别动物感染钩端螺旋体后确实存在差异，但是这种差异仅在感染低剂量时才能够体现出来，即在感染低剂量病原时雄性具有更严重的症状，包括存活率和病理评分以及病原负荷（载毒量）。进一步调查发现，病理评分的差异主要存在于肾脏，并且伴随着更高的炎症因子水平。新冠病毒引起的症状在不同性别间也有差异，而且我们也早就知道男女性之间的抗炎能力存在差异。但是为什么一些病原体的致病性在不同性别间有差异但是有些没有，虽然感染病原后都会引发炎症。以及为什么钩端螺旋体引起的炎症反应差异仅存在于肾脏中？研究没有继续深入，至此戛然而止。

#paper Reverse-transcribed SARS-CoV-2 RNA can integrate into the genome of cultured human cells and can be expressed in patient-derived tissues https://doi.org/10.1073/pnas.2105968118 许多新冠感染者康复后依然能通过PCR检测到病毒，但是却分离不到活病毒，考虑到新冠病毒是一种RNA病毒，因此合理怀疑其逆转录整合到了宿主基因组上。为了证实，作者使用了三种测序方法来对人类细胞来源的基因组测序，结果均发现了新冠基因组。此外作者还回顾了感染者组织来源的RNA测序数据，发现了包括新冠在内的许多病毒的转录本。比较简单的一篇论文，比较可看的地方是讨论。

#paper https://doi.org/10.3389/fvets.2020.00252 ，Frontiers in Veterinary Science，Contagious Yawning in African Elephants (Loxodonta africana): Responses to Other Elephants and Familiar Humans 你可能知道，打哈欠是会传染的，即当看到/听到/想到别人打哈欠时，也会不由自主跟着打哈欠。不仅如此，打哈欠也会在物种间相互传染，目前已知的是人与狗、人与黑猩猩间存在种间传染性打哈欠现象。虽然传染性打哈欠的发生机制和作用还不清楚，但据推测与个体间的社会沟通有关。大象具有高度发达的大脑，且社会化程度很高，为探究大象与人是否存在种间传染性哈欠，本文作者设计了一系列观察实验。实验对象是公园里的7头大象，它们每天按例与饲养员沟通，还要与游客互动。 在正式试验前，作者记录了大象打哈欠的频率：在觉醒时平均18小时打一个哈欠，这表明觉醒时自发打哈欠的频率很低。在正式试验中，饲养员在执行日常训练任务时，直视大象并且做出打哈欠动作（嘴巴缓慢张开、呆住，随后迅速闭合），对照试验为张嘴动作（缓慢张开、缓慢闭合）。结论是观察到了人象之间的种间传染性哈欠。

#paper doi:10.1186/s12864-022-08678-3 BMC Genomics，2022，From a large-scale genomic analysis of insertion sequences to insights into their regulatory roles in prokaryotes 插入序列（IS）作为可转移的外源序列，经常插入在原核生物基因组中。IS的插入有何影响？本文通过大范围的比较基因组分析探究了这个问题。在8481个基因组中鉴定到612700个IS插入，除了对这些IS和基因组类别进行分类描述外，作者还重点分析了IS的插入位置的偏好以及对基因组功能上的影响，他们发现IS普遍插入在基因功能与转录调控和转运活性有关的基因两侧，从而影响宿主的表型。IS影响宿主表型已是屡见不鲜，本研究从更广阔的范围内印证了这点，加深了我们对IS的了解，期望以后看到本领域更多的了解和新发现。

#paper doi:10.1128/IAI.71.11.6192-6198.2003 , infection and immunity, 2003, Genetic basis for the structural difference between Streptococcus pneumoniae serotype 15B and 15C capsular polysaccharides 肺炎链球菌血清型众多，血清型的不同取决于荚膜结构，且荚膜在激发免疫反应时占主导作用，因此血清型间缺少交叉保护作用。对肺炎球菌荚膜形成机制的深入了解有助于指导疫苗的开发。 此前有报道称血清型15B与15C会相互转化，这里，作者通过比较这两种血清型的荚膜编码基因，发现编码O-乙酰转移酶的基因中TA序列重复数量不同决定该酶是否有完全活性，进而导致荚膜结构不同。而TA数量的可变性，正是两种血清型可以相互转化的原因。 作者将荚膜结构不同的原因定位到了具体的基因，感觉是大道至简的规律。也为其他细菌的荚膜研究提供了参考和借鉴。