#paper DOI: 10.1086/301800 Am. J. Hum. Genet. 1998. Quantitative Analysis of Fetal DNA in Maternal Plasma and Serum: Implications for Noninvasive Prenatal Diagnosis. 这篇文献是1997年报道发现孕妇血浆的胎儿游离DNA之后，卢煜明团队发表的另一篇为后续NGS-based的NIPT检测技术有着基石意义的文章，其重要意义在于为后续基于大规模并行测序的无创产前检测方法奠定了定量基础。这篇文章采用real-time quantitative PCRs技术通过检测Y染色体上的标记基因来检测孕妇血浆和血清中的胎儿游离DNA含量，从而回答以下几个重点问题：（1）孕妇血浆中存在相当比例的胎儿cfDNA，在孕早期占比约3.9%（0.39–11.9%），孕晚期占比约6.2% (2.33–11.4%)，这一发现量化了胎儿cfDNA在孕妇血浆中的比例；（2）胎儿cfDNA约在妊娠7周时可被检测到，并随妊娠进程持续增加;(3)胎儿cfDNA存在于血浆和血清中，但血浆中占比更大，这一发现为后续将血浆作为NIPT检测样本来源奠定了基础。另外，这篇文章实验设计非常清晰严谨，内容详实。虽然在1998年，各种快速低成本的分子检测技术还未出现或者普及，仅使用qPCR方法就回答了上述能够连通基础科学发现与检测技术应用的一些关键问题。

#paper Ayub Q, Mezzavilla M, Pagani L, Haber M, Mohyuddin A, Khaliq S, Mehdi SQ, Tyler-Smith C. The Kalash genetic isolate: ancient divergence, drift, and selection. Am J Hum Genet. 2015 May 7;96(5):775-83. doi: 10.1016/j.ajhg.2015.03.012. Epub 2015 Apr 30. PMID: 25937445; PMCID: PMC4570283.这是一篇介绍基因与人种的文献，文章通过研究Kalash 基因研究人种的起源。卡拉什人代表了一个神秘的孤立的印欧语系人群，他们已经在今巴基斯坦的兴都库什山脉生活了几个世纪。在马其顿的亚历山大三世入侵该地区后，先前的 Y 染色体和线粒体 DNA 标记没有找到他们有希腊血统的有利证据。为研究该人种的起源。通过与古代狩猎采集者和欧洲农民的已发表数据进行比较表明，卡拉什人与旧石器时代西伯利亚狩猎采集者共享基因漂移遗传漂变，可能代表了一个极度漂移的古代北欧亚人群。自从从其他南亚种群中分离出来以来，卡拉什人一直保持着较低的长期有效种群规模。，并且没有从他们在巴基斯坦的地理邻居或其他现存的欧亚种群中检测到基因流动。 卡拉什人和目前居住在该地区的其他人群之间的平均分化时间估计为 11,800 年前（95% 置信区间 = 10,600−12,600年前）。基因分析表明他们代表了一些最早从西亚进入印度次大陆的移民的后代。

#paper doi:10.1016/j.ajhg.2024.12.013, The American Journal of Human Genetics, 2025, HiFi long-read genomes for difficult-to-detect, clinically relevant variants. 这篇文献来自PacBio，选取了100例病例，这些病例都携带有已知致病性胚系突变，且这些突变都难以在短读长测序中被检测，但已经经由其他诸如PCR、MLPA等各类方法确认过。使用长读长测序（LRS，PacBio HiFi）检测，其中93%的突变能够被测到（83%的突变能够在分析流程中被报出，而10%通过人工复核数据能够看到相应信号）。据此，说明LRS作为一种有前景的单一技术，可以用于罕见疾病的诊断。