来自杂志 Nature Methods 的文献。
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1.
白鸟
(2024-10-31 23:04):
#paper DOI: 10.1038/nmeth.3364，MiXCR: software for comprehensive adaptive immunity profiling. 2015年，milaboratory推出了MiXCR软件，MiXCR是二代测序TCR/BCR免疫组库分析软件，能有效处理双端和单端测序，考虑序列质量，纠正PCR错误并识别种系超突变。
（1）MiXCR比对：将测序读数与T细胞或B细胞受体的V、D、J 和 C基因进行比对；
（2）MiXCR组装：利用上一步获得的比对结果组装成克隆型（以提取特定基因区域，如 CDR3）；
（3）结果导出和绘图：将比对结果或克隆型结果导出和绘图；
MiXCR软件分学术版本和商业版本，软件封装得很好，几乎为所有商业/通用试剂盒开发了定制预配置的分析流程，单命令即可完成操作。