#paper Abscisic acid receptors functionally converge across 500 million years of land plant evolution, Current Biology,  24 February 2025,https://doi.org/10.1016/j.cub.2024.12.043. 在陆地植物早期，由于祖先型脱落酸ABA受体PYRABACTIN RESISTANCE 1-like蛋白(PYLs)具有较高的本底活性可直接和2C型蛋白磷酸酶(PP2Cs)互作，限制了植物对ABA感知范围；在被子植物中，ABA受体家族呈现显著的多样性，形成的二聚体实现了对ABA激素的低背景响应。作者发现苔藓类植物中的ABA受体PYL源于一个独立的扩张，产生了三个亚科。后续利用酵母双杂交和体外PP2C抑制试验证明，藓类植物的PYL受体具有较低的基础活性。色谱分析和相关的生化实验证据表明，藓类植物PYL受体的蛋白主要以单体形式存在。突变分析与生理生化分析相结合表明，藓类植物的PYL的活性调节可能是由于门环结构中的关键氨基酸变异引起。这一研究揭示了苔藓植物在进化中，PYL结构上表现出差异；藓类植物进化出了单体、低信号活性的ABA感知装置。因此，苔藓植物经历了独立的进化，进化出了相同的低背景下的ABA激素的感知能力，只在需要时才能激活相关通路从而优化了对ABA感知范围幅度。

#paper Reconstructing the Transcriptional Ontogeny of Maize and Sorghum Supports an Inverse Hourglass Model of Inflorescence Development， Current Biology, October 21, 2019. https://doi.org/10.1016/j.cub.2019.08.044.对玉米和高粱的穗构建了不同发育时期的转录组图谱，借助转录本动力学确定了玉米抽穗和高粱穗发育阶段，然后利用随机森林确定了基因表达预测，发现这两个物种在将干细胞命运方面最相似。这个工作对我最近分析多物种的比较转录组很有启发。

#paper Järve M, Saag L, Scheib CL, Pathak AK, Montinaro F, Pagani L, Flores R, Guellil M, Saag L, Tambets K, Kushniarevich A, Solnik A, Varul L, Zadnikov S, Petrauskas O, Avramenko M, Magomedov B, Didenko S, Toshev G, Bruyako I, Grechko D, Okatenko V, Gorbenko K, Smyrnov O, Heiko A, Reida R, Sapiehin S, Sirotin S, Tairov A, Beisenov A, Starodubtsev M, Vasilev V, Nechvaloda A, Atabiev B, Litvinov S, Ekomasova N, Dzhaubermezov M, Voroniatov S, Utevska O, Shramko I, Khusnutdinova E, Metspalu M, Savelev N, Kriiska A, Kivisild T, Villems R. Shifts in the Genetic Landscape of the Western Eurasian Steppe Associated with the Beginning and End of the Scythian Dominance. Curr Biol. 2019 Jul 22;29(14):2430-2441.e10. doi: 10.1016/j.cub.2019.06.019. Epub 2019 Jul 11. PMID: 31303491. 这是一篇DNA检测与考古相结合的文章，文章对欧洲西部草原古代人类DNA进行研究，根据古代 DNA 证据，铁器时代早期的游牧斯基泰人被描述为不同起源的部落联盟 。研究提供了 31 个古代西方和东方草原个体的新全基因组序列，包括斯基泰人以及他们之前和之后的样本，在斯基泰人统治初期的铁器时代早期滨海基因库中检测到东部（阿尔泰）亲和力的增加以及东部狩猎采集者血统的减少。乌克兰斯基泰人之后的切尔尼亚希夫文化样本中近东血统的比例明显高于本研究的其他样本。基因构成与后斯基泰切尔尼亚希夫文化的哥特式起源一致。