来自杂志 Briefings in Bioinformatics 的文献。
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1.
前进
(2024-11-30 23:26):
# paper DOI: [10.1093/bib/bbv088](https://doi.org/10.1093/bib/bbv088) A Comparison of Base-calling Algorithms for Illumina Sequencing Technology
这篇论文主要讲述了Illumina测序技术中用于basecalling的不同算法的性能比较。文章提供了一个综合的比较分析,涵盖了多种最近开发的bascalling算法,并提出了一个统一的统计模型,该模型能够涵盖大多数现有的basecall算法。研究的目的在于通过比较这些算法在处理Illumina平台产生的测序数据时的准确性和效率,来帮助科研人员选择最适合他们需求的basecall工具。论文中提到的算法包括Bustard、Srfim、AYB、Ibis和freeIbis等,并通过实验数据评估了它们的对齐率、错误率和区分能力。通过这些比较,论文旨在为高通量测序数据分析中basecall步骤提供指导和建议。
Briefings in Bioinformatics,
2016-9.
DOI: 10.1093/bib/bbv088
Abstract:
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