#paper doi：https://doi.org/10.1038/s41587-021-00830-w Robust decomposition of cell type mixtures in spatial transcriptomics 空间转录组学技术的局限在于，每个spot的测序数值可能来自于不同细胞的贡献，这样不利于细胞特异性和空间表达模式特异性的挖掘。本篇文章的作者开发了一个稳定性比较高的软件：RCTD，它利用从单细胞数据中细胞特异性谱图的表达水平，预测每个spot中细胞类型，并计算出每种细胞的权重。RCTD计算了小鼠Slide-seq跟visium数据集中准确的再现了已知的细胞类型和亚型细胞定位模式。不过这个方法结果的可靠程度依赖于注释好的单细胞数据集的质量，因此选择质量好的单细胞数据集，或者细胞注释准确度高的与空间数据匹配好的单细胞数据集是非常重要的。选择RCTD对空间数据spot的细胞类型的空间成分，揭示生物组织中细胞组织的新原理。

https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0092867421005018本文应用成熟小鼠的脑组织借助merish技术对55张小鼠的冠状脑组切片测序空间转录组，同时测序对应样本的单细胞（质控后4 000 000个）。依据不同切面不同脑区的时空组表达特征的不同，每张切片都分成不同的功能分区，而大脑总的大分区11个region，时空组都可以很好地再现不同脑区的结构和空间特征。作者还应用RCTD的方法联合时空和单细胞数据，预测不同脑区的细胞类型，整个大脑组织的脑细胞分为34个亚群，其中90%的亚群种类都是神经元细胞，其中每个区的兴奋性神经元数量都是高于抑制性神经元。不同脑区神经元除了表达神经元细胞共有marker以外，还表达具有空间特异性的神经元marker，且不同脑区的神经元细胞种类差异非常大，以中脑和后脑的神经元细胞种类最为丰富。该文献展示了成年小鼠脑细胞的分子和空间特征图谱，为后来的小鼠大脑组织研究提供了数据支持。

DOI: 10.1038/s41586-018-0453-z 目前我们已经发现数千种长链非编码RNA（lncRNA），但是明确功能的只有十几种。德克萨斯西南医学研究中心Mendell教授发现lncRNA-NORAD可以在维持基因组稳定性上非常重要。此外，还报道了PUMILIO是NORAD唯一相互作用的RNA结合蛋白，但是相关的作用机制我们并不清楚。最近 哈弗-麻省理工学院lander教授提出了NORAD和RNA结合蛋白PUMILIO的相互作用，对NORAD功能发挥具有重要作用。NORAD和PUMILIO结合后，NORAD调节PUMILIO组装拓补异构酶复合物的能力，该复合物在维持基因组稳定性具有重要作用。实验证明细胞在PUMILIO敲除后的表型，与PUMILIO敲除表型密切相关，都表现为染色质分离增加，复制叉速度降低和细胞周期改变。在PUMILIO正常表达的细胞，补充NORAD，可以补救NORAD缺失引起的基因组不稳定，但是在NORAD的作用位点缺失以后，挽救效果就很差。这说明NORAD是通过特定位点与PUMILIO相互作用，促进拓补异构酶复合物组装并参与维持基因组稳定性。但是对于NORAD与PUMILIO的相互作用如何促进拓补异构酶复合物组装的，lander教授提出了多个可能的机制，这些机制还有待进一步实验验证。

https://movementdisorders.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/mds.29430本文应用浙江大学第二附属医院神经内科随访的亨廷顿病人信息，构建模型，经过分析发现患者血液中神经丝轻蛋白（Neurofilament light protein）可以预测Huntington's disease亨廷顿病人的发病年龄。这个蛋白主要跟发病年龄，发病前脑白质病变程度有关，但是跟发病之后的严重程度没有统计学关联。亨廷顿基因的串联重复序列数目越多，发病年龄也越早，而发病前重复序列数目多的患者，其NFL水平也比较高。总之，NFL可以作为预测亨廷顿病发病年龄的生物学marker，是本文解决的一个重要临床问题。