孤舟蓑笠翁 (2025-06-29 09:36):
#paper 【doi】10.1038/s41586-025-09182-w;【发表年份】2025年;【期刊】Nature;【标题】In vivo mapping of mutagenesis sensitivity of human enhancers。【内容总结】这篇论文想搞清楚人类增强子(控制基因开关的DNA片段)中哪些小片段对胚胎发育最关键。科学家选了7个控制大脑、心脏和四肢发育的增强子,用转基因小鼠做实验:先把这些增强子切成12碱基的小块,用CRISPR技术突变每个小块,然后观察突变后胚胎器官发育的变化(主要看颜色标记的LacZ基因表达)。他们发现69%的小块突变会影响发育(60%让增强子失效,9%反而增强活性),并用机器学习模型预测出88%的关键位点与实验结果吻合。简单说就是:像拆乐高一样把增强子拆成小零件,发现大部分零件都重要,突变会搞乱发育;还训练AI模型来预测哪些零件最关键,结果挺准。主要方法包括:转基因小鼠胚胎实验(enSERT技术)、12bp块突变策略、ChromBPNet机器学习模型分析染色质开放信号、DeepLIFT算法定位关键碱基。
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