半面阳光
(2025-04-30 22:51):
#paper doi: https://doi.org/10.1016/j.gim.2023.100947. Genetics in Medicine. 2023. The landscape of reported VUS in multi-gene panel and genomic testing: Time for a change. 意义不明变异（Variants of Uncertain Significance，VUS）在基因诊断检测中较为常见，这类变异可能导致临床解读困难，并产生额外的后续成本，包括临床医生额外的时间投入。这篇文章的主要是为了调查多基因panel（Multi-gene Panels，MGPs）和外显子组及基因组测序（Exome and Genome Sequencing，ES/GS）诊断检测报告的VUS结果的发生率，评估不确定结果的影响范围，并探索减少其潜在不良影响的方法。研究收集了2020年至2021年间，北美地区19家临床实验室超过150万份测序检测报告的数据，分析因VUS导致的结果不确定率。结果发现，ES/GS导致的不确定结果（VUS）发生率（22.5%）显著低于MGPs（32.6%；P < .0001）。在MGPs检测中，不确定结果的发生率与检测基因数量呈正相关。与单样本检测相比，家系检测（trios，即父母-子女三人组合）能明显降低不确定结果的发生率（18.9% vs 27.6%；P < .0001），而基因组测序（GS）与外显子组测序（ES）相比在VUS发生率上无显著差异（22.2% vs 22.6%；P = ns）。 在多基因panel（MGPs）的检测中，观察到的VUS高发生率提示需要重新审视现行的变异报告规范。文章提出了一些减少VUS报告率的方法，采用其他方法（如对VUS进行亚分类及提供补充报告信息）或可同时提升两类检测的有效性。文章还根据研究结果的提示，建议将临床资源重点用于对有临床意义的VUS进行进一步跟踪评估。
Genetics in Medicine,
2023-12.
DOI: 10.1016/j.gim.2023.100947
The landscape of reported VUS in multi-gene panel and genomic testing: Time for a change
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Abstract:
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