#paper doi: 10.1016/j.molcel.2017.04.010 Molecular Cell, 2017, Dynamic Rewiring of Promoter-Anchored Chromatin Loops during Adipocyte Differentiation。这篇旧文是目前已知的唯一一项以3T3-L1细胞的体外脂肪分化过程为研究对象的三维基因组学研究。作者使用Promoter capture Hi-C (PCHi-C)技术测定了分化过程中的关键时点的染色质构象图谱，结合对应时点的RNA-seq，重要转录因子和组蛋白修饰信号进行了联合分析。结果显示TAD结构在分化全称保持稳定，Promoter-enhancer相互作用（EPI）表现出明显的与分化过程中的基因表达调控模式一致的成波次状的增强和消退。这些行为与H3K27ac的富集和消退高度一致，而与H3K4me1/2无关。此外，在与Promoter相连的Enhancer上同时富集激活信号如MED1/SMC1/P300，和抑制信号如NcoR/HDAC，反映出EPI对基因表达的复杂调控作用。本文提供了一套比较全面的3T3-L1分化过程的表观组学数据，其分析和可视化方法均有可借鉴之处，尤其是对三个时点的序贯数据的分析和呈现。