李翛然
(2026-02-28 14:54):
#paper MiMiCPy-FM: A User-Friendly Force Matching Tool for Extending the Time Scale of QM/MM MD MiMiC Simulations.
doi:10.1021/acs.jcim.5c03185
该工具基于通用 QM/MM 力场匹配方法构建，深度集成于 MiMiCPy 生态，支持命令行快速执行与 Python 库个性化调用双模式。其核心优势在于实现了 QM/MM 体系向经典分子动力学（MD）的无缝衔接，可自动完成 D-RESP 电荷分配与键合力场参数拟合，兼容有无共价 QM/MM 边界的复杂体系，直接输出 GROMACS 兼容拓扑文件。基于 MiMiCPy-FM 的力场匹配实施流程图性能验证表明，MiMiCPy-FM 在丙酮水溶液体系中达到同类方法拟合精度；在 Mg 基酶 IDH1 药理体系应用中。
Journal of Chemical Information and Modeling,
2026-2-20.
DOI: 10.1021/acs.jcim.5c03185
MiMiCPy-FM: A User-Friendly Force Matching Tool for Extending the Time Scale of QM/MM MD MiMiC Simulations
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Abstract:
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