paper 【doi】10.1038/s41588-025-02449-y；【发表年份】2026年；【期刊】Nature Genetics；【标题】Protein-protein interactions shape trans-regulatory impact of genetic variation on protein expression and complex traits。【内容总结】这篇论文想弄明白我们的基因差异（遗传变异）是如何通过影响蛋白质之间的相互作用，最终决定我们血液里蛋白质的多少（表达水平），并影响身高、疾病风险等复杂特征的；为此，研究人员重新分析了英国生物银行血浆蛋白质组计划（UK Biobank Pharma Proteomics Project, UKB-PPP）这个大型数据库，重点比较了影响蛋白质水平的遗传位点（pQTL）和影响信使RNA水平的位点（eQTL）的效应强弱，并开发了一种叫trans-PCO的新方法来找出那些能“远程调控”（trans调控）蛋白质表达的遗传变异，同时严格控制了数据分析过程以避免假信号。他们发现，那些“远程调控”蛋白质的遗传效应，其强度远超“远程调控”RNA的效应（trans-to-cis z-score比率更高），并且蛋白质表达水平的遗传差异有89-90%是由这种“远程调控”贡献的，而RNA只有60-79%；这些执行“远程调控”的基因往往更重要、更受进化约束（高pLI评分基因占27.2%），并且与36%的复杂疾病GWAS位点（例如类风湿性关节炎RA的位点）存在关联，而直接调控的基因仅关联10.1%；最关键的是，他们证实蛋白质相互作用网络是这种“远程调控”的主要途径，相关信号在相互作用网络中富集了5.4倍，并据此新发现了17,662个“远程调控”位点，这些位点能将多个看似不相关的疾病位点（如6个RA风险位点）联系到同一个蛋白质相互作用系统（如BAFF/APRIL系统）上，从而解释了疾病发生的可能通路。