#paper The genomic basis of geographic differentiation and fiber improvement in cultivated cotton, Nature Genetics, 15 April doi:2021,10.1038/s41588-021-00844-9. 棉花作为纺织的重要原材料，随着人类的活动得到了广泛的传播。在长期的自然选择和人工育种的效应下重塑了棉花的生态适应能力，但是这种能力的获取是通过染色体的变化获得的，那么该团队对收集的3278个棉花进行了测序，筛选了3,248株四倍体棉花（3K-TCG），其中包括2,922株G. hirsutum、309株G. barbadense和17种野生近亲。通过分析遗传多样性与种群分化，把样品分成了六个亚组。对两个亚组两两之间进行Fst计算后，发现在改良品种（G3–G6）中，A06和A08染色体出现显著分歧，这两条染色体跨越广泛的基因组区域，分别存在于G3（A06基因组分歧）和G5（A08基因组分歧）亚群。高度差异化的基因组区域可能推动了改良品种内亚群的分化。这种染色体基因组上的显著分歧，以及G3亚组（大多数入植来自北卡罗来纳和西北地区）和G5亚组（大多数入植来自YZR）的地理起源，暗示了基因组分化与棉花品种地理分化之间可能存在关系，为了揭示这种联系，利用A06和A08染色体上SNP构建了系统发育树，鉴定出了主要的单倍型。后续发现这些单倍型跟生态环境显著相关。渗入和关联分析发现了新的纤维质量相关位点，并证明两个二倍体棉的引入等位基因对纤维质量提升有显著影响。这些位点为克服纤维质量瓶颈提供了潜在力量。