孤舟蓑笠翁
(2025-06-21 11:32):
#paper 【doi】10.1038/s41588-025-02193-3;【发表年份】2025年;【期刊】Nature Genetics;【标题】High-definition spatial transcriptomic profiling of immune cell populations in colorectal cancer。【内容总结】本研究的目标是探索结肠癌中免疫细胞的空间分布和功能,使用高分辨率空间转录组学技术来理解肿瘤微环境的复杂性,以改善诊断和治疗策略;方法包括Visium HD空间转录组学(提供单细胞尺度分辨率)、单细胞RNA测序(创建参考数据集)、Xenium原位基因表达分析(用于验证)、空间距离分析(如肿瘤边界50微米范围)、差异基因表达以及配体-受体相互作用预测;结果识别了两个巨噬细胞亚群(SELENOP+和SPP1+),它们在空间上分离并富集于不同通路,表明各自在促进肿瘤进展中的作用,例如SPP1+巨噬细胞与TGFBI+肿瘤细胞和基质细胞共定位促进侵袭,而SELENOP+巨噬细胞与特定肿瘤细胞相互作用抑制免疫反应,同时通过Xenium验证发现克隆扩增的T细胞与表达趋化因子的巨噬细胞共定位,揭示潜在抗肿瘤微环境。简言之,研究证明了Visium HD的高分辨率和准确性,揭示了结肠癌中免疫细胞的异质性空间组织和功能互作,为靶向治疗提供新见解。
Nature Genetics,
2025-6.
DOI: 10.1038/s41588-025-02193-3
High-definition spatial transcriptomic profiling of immune cell populations in colorectal cancer
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Abstract:
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