#paperDOI:10.3389/fpls.2018.009022018-06-29 Functional Microbial Features Driving Community Assembly During Seed Germination and Emergence 驱动种子萌发与出苗期间群落组装的功能性微生物特征 plant science 影响因子：4.1JCR分区：2区 - 生化与分子生物学1区 - 植物科学中科院分区：2区年发文量：294 种子及其周围发生的微生物相互作用对植物的适应性尤其重要，因为种子携带的微生物是植物微生物群落最初接种源。在本研究中，我们分析了植物生命周期早期阶段——即萌发和出苗阶段——植物微生物群落内部发生的结构与功能变化。为此，我们对两种植物物种：菜豆和萝卜的种子、萌发种子及幼苗相关微生物群落进行了鸟枪法DNA测序。我们观察到，在出苗过程中肠杆菌目和假单胞菌目的丰度显著增加，并且发现了一系列与富营养型代谢相关的功能特征，这些特征可能正是由于萌发后养分供应增加而导致的这一选择结果。从幼苗中筛选出的代表性细菌分离株的确表现出比种子相关细菌分离株更快的生长速率。最后，通过宏基因组重叠群聚类，我们重建了与样品相关的主要细菌类群的群体基因组。综合我们的研究结果表明，尽管不同植物物种的种子微生物群落存在差异，但萌发期间的养分供应却会引发微生物群落组成的改变，从而可能选择出具有与富营养型代谢相关功能特征的微生物类群。本文所呈现的数据首次以实证方式评估了植物出苗过程中微生物群落的变化，推动我们朝着更全面地理解植物微生物组的方向迈进。