张贝
(2022-09-30 18:50):
#paper doi: 10.1038/s41587-020-0548-6. PICRUSt2 for prediction of metagenome functions. Nat Biotechnol. 2020. PICRUSt2是一款基于标记基因序列（通常为16S rRNA）来预测宏基因组功能丰度的软件，本文自2020年发表以来，已被引用近1200次（Google Scholar）。PICRUSt2在原有PICRUSt1版本的基础上进行升级，更新了基因家族和参考基因组数据库（扩大10倍以上），可与任何OTU选择或去噪算法的互操作，并能够进行表型预测。Benchmarking结果表明，PICRUSt2总体上比PICRUSt和其他竞争方法更准确。同时，PICRUSt2还允许添加自定义参考数据库。
IF:33.100Q1
Nature biotechnology,
2020-06.
DOI: 10.1038/s41587-020-0548-6
PMID: 32483366
PMCID:PMC7365738
PICRUSt2 for prediction of metagenome functions
翻译
Abstract:
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