cellsarts (2025-09-30 16:17):
#pape rMarine GenomicsDOI:10.1016/j.margen.2023.1010452023-05-26 基于宏基因组分析的西南印度洋深海沉积物中固碳微生物及其固碳途径 化学自养微生物在黑暗海洋中的碳固定对海洋初级生产和全球碳循环做出了巨大贡献。与海洋光合作用区占主导地位的卡尔文循环不同,深海区域的碳固定途径及其宿主是多样化的。在这项研究中,收集了西南印度洋靠近热液喷口的四个深海沉积物样本,并使用宏基因组分析处理,以研究碳固定潜力。功能注释显示,所有六种碳固定途径在样本中都有不同程度的基因存在。还原型三羧酸循环和卡尔文循环基因在所有样本中都有出现,与先前研究发现主要存在于热液区域的伍德-隆德哈德途径相反。注释还阐明了与六种碳固定途径相关的化学自养微生物成员,其中大多数含有关键碳固定基因的属于假单胞菌门和脱硫杆菌门。分箱宏基因组组装的基因组显示,卡尔文循环和3-羟基丙酸/4-羟基丁酸循环的关键基因也存在于罗红藻目和真菌家族Hyphomicrobiaceae中。通过识别西南印度洋热液场的碳代谢途径和微生物种群,我们的研究揭示了深海环境中复杂的生物地球化学过程,并为进一步深入研究深海生态系统的碳固定过程奠定了基础。 Xiao-Lan Yue Lin Xu Li Cui Ge-Yi Fu Xue-Wei Xu Marine GenomicsDOI:10.1016/j.margen.2023.1010452023-05-26
Metagenome-based analysis of carbon-fixing microorganisms and their carbon-fixing pathways in deep-sea sediments of the southwestern Indian Ocean
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