#paper genome-wide spectrum of tandem repeat expansions in 338,963 humans. Cell. 2024 Apr 25;187(9):2336-2341.e5. doi: 10.1016/j.cell.2024.03.004. Epub 2024 Apr 5. PMID: 38582080. 在本篇文章中，作者建立了一个名为TR-gnomAD的串联重复（TR）扩增的生物库规模参考数据库，该数据库涵盖了338,963个全基因组测序样本，其中包括39.5%的非欧洲样本。本研究使用了ExpansionHunter和GangSTR两种基因分型工具来增加TR基因分型的覆盖率。TR-gnomAD提供了关于TR单元数量频率差异的洞见，这些差异揭示了特定祖源与疾病风险之间的联系。例如，作者发现特定祖源中TR单元的扩增频率与某些遗传病的流行程度相关联，比如非洲后裔中肌阵挛型营养不良的DMPK基因中的CAG重复扩增较欧洲后裔中的较少。 阅读思考：TR-gnomAD的建立极大地丰富了我们对人类基因组中TR区域多样性的理解，并提供了一种全新的角度来观察遗传疾病与特定人种间的关联。这项研究强调了TR扩增在特定祖源中可能具有的疾病相关性，特别是在ALS、亨廷顿病等超过50种与TR扩增相关的致命性疾病中。此外，该数据库也对临床诊断提供了重要的参考，尤其是在使用TR 单元数差异来预测疾病风险方面。然而，该研究的一个限制是其主要依赖于短读测序数据，可能导致对大的TR扩增区域的等位基因长度估计不足。未来研究需结合长读测序技术，以提供更准确的TR扩增数据，从而更好地服务于遗传疾病的风险评估和诊断。