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2020, Cell Reports. DOI: 10.1016/j.celrep.2020.108206
tagHi-C Reveals 3D Chromatin Architecture Dynamics during Mouse Hematopoiesis
Chao Zhang, Zihan Xu, Shangda Yang, Guohuan Sun, Lumeng Jia, Zhaofeng Zheng, Quan Gu, Wei Tao, Tao Cheng, Cheng Li, Hui Cheng
Abstract:
No abstract available.
2024-03-31 16:26:00
#paper doi: 10.1016/j.celrep.2020.108206 Cell Reports, 2020, tagHi-C Reveals 3D Chromatin Architecture Dynamics during Mouse Hematopoiesis。高通量染色质构象捕获技术(Hi-C)一直受限于对样品量的高要求而在一些只有有限样品的场景中应用受限。本文作者介绍了一种借助tagmentation原理的改进版tagHi-C,借助Tn5的低样品损失可以将Hi-C对样品的需求降低到百细胞量级。基于此,作者解析了小鼠造血系统发育过程中的染色质构象改变。发现染色质区室结构随造血系统的发育是高度动态的,终端分化细胞染色质呈现凝聚状态,高表达基因可自身形成结构域且结构域强度与表达水平正相关等结论。本文是in situ Hi-C以来对该技术的一项重大改进。提供了一套完整的Hi-C测试数据。
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