2021,
Nature Methods.
DOI:
10.1038/s41592-021-01282-5
Single-cell chromatin state analysis with Signac
Tim Stuart, Avi Srivastava, Shaista Madad, Caleb A. Lareau, Rahul Satija
Abstract:
No abstract available.
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2024-03-31 23:05:00
白鸟:
#paper Single-cell chromatin state analysis with Signac. Nat Methods (2021). https://doi.org/10.1038/s41592-021-01282-5
最近分析scATAC-seq数据，用到Signac的一些函数，特别GeneActivity函数的理解。系统的学习和理解一个分析工具，还是要花大量的时间，工具包的整体分析思路，源码中如何一步步实现的，fragments到peak，peak的注释，分析延展，与同类软件的对比，需要一点点理解和消化。