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2020, PLOS Computational Biology. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1007531
Ten simple rules for providing effective bioinformatics research support
Judit Kumuthini, Michael Chimenti, Sven Nahnsen, Alexander Peltzer, Rebone Meraba, Ross McFadyen, Gordon Wells, Deanne Taylor, Mark Maienschein-Cline, Jian-Liang Li, Jyothi Thimmapuram, Radha Murthy-Karuturi, Lyndon Zass
Abstract:
No abstract available.
2023-11-29 11:48:00
#paper doi: 10.1371/journal.pcbi.1007531. Kumuthini J, et al. Ten simple rules for providing effective bioinformatics research support. PLoS Comput Biol. 2020 Mar 26;16(3):e1007531. 高通量测序技术的普及使得生物信息分析的需求逐渐增加,然而,作为一名生物信息分析工作者,应该如何有效地与实验室科学家合作呢?本研究的作者们结合自身多年交叉学科的数据分析经验,为此总结出十条简单但有效的规则。(1)充分了解实验设计。(2)明确数据分析项目的范围、达成路径和预期结果。(3)对数据进行全面和科学的管理,例如及时备份。(4)数据分析步骤和结果应该可追溯。(5)明确包含样本信息的元数据的存储形式和内容。(6)注意数据安全。(7)在项目的整个生命周期都需要进行质量控制。(8)选择合适的数据分析工具。正确选择的前提是了解使用工具的优点和局限性,是否被科研人员广泛使用。(9)及时记录数据分析过程中的每一次修改。(10)对于不可用的数据,及时与实验科学家沟通,必要时要重新调整该数据的用途。
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